粟耀莹•加州理工-高盛2
2007年4月28日
[6] 到生物系找指导教授
1993年，加州理工已公认我是本校物理系与生物系合作的拓荒者。在我之前，这所全美首屈一指的理工名校，还不曾有过一个扮演这种角色的人。至拓出什么名堂来，很多人还在看。但我的名气是不缺，所有生物系的教授都认识我。我很欣慰的是，1998年我博士毕业那一年，加州理工生物系特别成立了一个“生物物理奖学金”，开放给所有希望在物理与生物交界处作研究的博士生，就是像我这种人。
1993年的万圣节，我参加加州理工校园举办的万圣节Halloween Party。加州理工本来就是有名的怪，再加上万圣节这个作怪的节日，怪上加怪可想而知。每个人的装扮不止是面具，披风，有人用玻璃和晶体管把自己围住，装扮成计算机司服器computer server，引起很多人围观。那真的很厉害，从外面看还真的以为是计算机司服器。
我就是在那个舞会上，遇见Steve Mayo我后来的博士论文指导教授，和他的第一个研究生Bassil Dahiyat。
Steve Mayo那时刚被加州理工聘进来当助理教授，他想做一个可以做蛋白质设计的计算机软件。Steve在大学时就写过一软件程序做分子模型模拟，在加州理工念博士时，就是把大学写的软件程序推广，后来和他的指导教授一起成立了一家公司专卖这个软件给学术机构和大公司的研究部门。最后这家公司被 Pharmacopia 收购，Steve的股票大赚了一笔。
Bassil Dahiyat大学念的是约翰-霍普金斯，三年就毕业，后来在约翰-霍普金斯又待了两年，不但拿了硕士，还替他的指导教授成立实验室，发表多篇论文。Bassil的专长是Biomedical Engineering生医工程，理论实验都非常厉害，是那一年加州理工有名的高材生。
这两人1993就有一个远景，要把这个蛋白质设计的计算机软件做出来，并且商业化。
我一听，觉得这就是我想做的方向，第二天就去Steve Mayo的实验室和他谈，他也欣然答应受我作学生。因为他就是要找对生物有兴趣，但又能用理论的方式建立模型的人。
那时我是Steve Mayo的第三个门生，Steve Mayo 的第二个门生叫做Jay，是中国科大的高材生，得过科大的最高荣誉之一的郭末若奖学金。但Jay没有选择做蛋白质设计的计算机软件，作别的博士题目。
Steve Mayo，Bassil Dahiyat，和我，三个人就展开了几年蛋白质工程的科技商业化之路。
1993年，加州理工已公认我是本校物理系与生物系合作的拓荒者。在我之前，这所全美首屈一指的理工名校，还不曾有过一个扮演这种角色的人。至拓出什么名堂来，很多人还在看。但我的名气是不缺，所有生物系的教授都认识我。我很欣慰的是，1998年我博士毕业那一年，加州理工生物系特别成立了一个“生物物理奖学金”，开放给所有希望在物理与生物交界处作研究的博士生，就是像我这种人。
1993年的万圣节，我参加加州理工校园举办的万圣节Halloween Party。加州理工本来就是有名的怪，再加上万圣节这个作怪的节日，怪上加怪可想而知。每个人的装扮不止是面具，披风，有人用玻璃和晶体管把自己围住，装扮成计算机司服器computer server，引起很多人围观。那真的很厉害，从外面看还真的以为是计算机司服器。
我就是在那个舞会上，遇见Steve Mayo我后来的博士论文指导教授，和他的第一个研究生Bassil Dahiyat。
Steve Mayo那时刚被加州理工聘进来当助理教授，他想做一个可以做蛋白质设计的计算机软件。Steve在大学时就写过一软件程序做分子模型模拟，在加州理工念博士时，就是把大学写的软件程序推广，后来和他的指导教授一起成立了一家公司专卖这个软件给学术机构和大公司的研究部门。最后这家公司被 Pharmacopia 收购，Steve的股票大赚了一笔。
Bassil Dahiyat大学念的是约翰-霍普金斯，三年就毕业，后来在约翰-霍普金斯又待了两年，不但拿了硕士，还替他的指导教授成立实验室，发表多篇论文。Bassil的专长是Biomedical Engineering生医工程，理论实验都非常厉害，是那一年加州理工有名的高材生。
这两人1993就有一个远景，要把这个蛋白质设计的计算机软件做出来，并且商业化。
我一听，觉得这就是我想做的方向，第二天就去Steve Mayo的实验室和他谈，他也欣然答应受我作学生。因为他就是要找对生物有兴趣，但又能用理论的方式建立模型的人。
那时我是Steve Mayo的第三个门生，Steve Mayo 的第二个门生叫做Jay，是中国科大的高材生，得过科大的最高荣誉之一的郭末若奖学金。但Jay没有选择做蛋白质设计的计算机软件，作别的博士题目。
Steve Mayo，Bassil Dahiyat，和我，三个人就展开了几年蛋白质工程的科技商业化之路。
[7] 我做出了一个经典生物物理模型
Steve Mayo的实验室才刚开张，由于Steve在计算机方面的功力和成功的科技商业化(Technology Commercialization) 成功经验，实验经费相当宽裕，尤其是私营的研究经费。Steve用了这些经费先买了好几台计算机，SGI，Sun，Mac，各种版本的都有，编译器也是有Fortran和C语言的。也买了一台600的NMR全美只有最专业的地方才有。其它的实验器材在慢慢的采购之中，实验室每天茁壮成长，渐渐成型。
那时，有个名气很大、人也非常好的犹太教授亨利-乐斯特 (Henry Lester) 和他一个超强的助手，从以色列来的犹太博士后研究生瑟拉-美革 (Sela Mager) 他们有非常稀有的数据，从某稀有蛋白质 (neuro-transmitter transporter)上量到。这种蛋白质，对了解药物上瘾，有很重要的药理功能。他们希望对这一类的蛋白质输送分子的行为，做一个动力模型，以方便日后科学家对药物上瘾学的研究。有一天，他两走进我们的实验室，找Steve谈。因为这个模型的建立需要用计算机，写程序，是Steve的专长。
Steve那时正亲手写一个快速寻找的计算机程序，没有这个程序，蛋白质设计的计算机软件是无方运做的，故在等这个程序的过程中，Bassil和我都先做其它的项目。Bassil和Beckman Institute 的一个实验室合作，做实验。我则在Steve，Henry和Sela，的同意和指导下，开始我的第一个研究计划，为他们的实验数据做一个模型。
制作生物学模型须依助计算机。当时我的计算机功力还不强，还没有完成过高级的设计。正在这时候，一个计算机方面的厉害角色，出现在我的身边。
这个人叫Erik Winfree，是个德国裔的犹太人，只比我大两岁。他在计算机方面不是普通的高强，真称得上是圣手级。Erik的父亲Art Winfree是有名的教授，得过McArthur (Genius) Award，在美国那个叫天才奖。Erik也替Mathematica的创办人，也是加州理工前校友，另一个天才Steve Wolfram做过程序及研究。这种背景，计算机与逻辑的功力真是无庸置疑。Erik在拿到博士学位后，立刻被加州理工聘为教授，这是极少极少有的事。有其父必有其子，他后来也拿了一个McArthur (Genius) Award。
Erik和我常常就这个模型讨论，也在计算机方面给我的指导。Henry和Sela也很够意思，每有新资料就喂给我的模型。Sela和我也经常就这个模型进行讨论。讨论到一定程度是，就报告给Henry看还有没有要改进的地方。他们本来只要解释他们自己的数据，结果看哪个模型越来越厉害，连他们还没测量到数据也可以预测，就变本加厉把别的实验室量到，有关这种新潮蛋白质的资料也拿来看我们的模型是否能解释。给他们这样一搞，这个模型把那时所有的数据都不但解释，而且预测到了。
我所做出的这模型，不但可以解释Henry和Sela他们发现的现象，还可预测一些别的新的实验现象，这些预测到的现象，后来在其它的实验室如UCLA的名实验室中被发现，因此我做的模型在生物学界相当轰动，Henry和Sela到那一阵到什么地方都讲这模型。
Henry和Sela这两个老犹对我完成的工作满意极了，他们在我毕业后为我写求职推荐信时，把我写得非常完美。Henry和Sela是很典型的犹太人(Henry的儿子取名叫Ben，可想而知)我为此不但对他俩，也爱屋及乌，对所有的犹太人充满预先的敬意。
1995年，我从加州理工发表的第一篇科学论文，就是说明这个模型所统合的各种现象。
Steve Mayo的实验室才刚开张，由于Steve在计算机方面的功力和成功的科技商业化(Technology Commercialization) 成功经验，实验经费相当宽裕，尤其是私营的研究经费。Steve用了这些经费先买了好几台计算机，SGI，Sun，Mac，各种版本的都有，编译器也是有Fortran和C语言的。也买了一台600的NMR全美只有最专业的地方才有。其它的实验器材在慢慢的采购之中，实验室每天茁壮成长，渐渐成型。
那时，有个名气很大、人也非常好的犹太教授亨利-乐斯特 (Henry Lester) 和他一个超强的助手，从以色列来的犹太博士后研究生瑟拉-美革 (Sela Mager) 他们有非常稀有的数据，从某稀有蛋白质 (neuro-transmitter transporter)上量到。这种蛋白质，对了解药物上瘾，有很重要的药理功能。他们希望对这一类的蛋白质输送分子的行为，做一个动力模型，以方便日后科学家对药物上瘾学的研究。有一天，他两走进我们的实验室，找Steve谈。因为这个模型的建立需要用计算机，写程序，是Steve的专长。
Steve那时正亲手写一个快速寻找的计算机程序，没有这个程序，蛋白质设计的计算机软件是无方运做的，故在等这个程序的过程中，Bassil和我都先做其它的项目。Bassil和Beckman Institute 的一个实验室合作，做实验。我则在Steve，Henry和Sela，的同意和指导下，开始我的第一个研究计划，为他们的实验数据做一个模型。
制作生物学模型须依助计算机。当时我的计算机功力还不强，还没有完成过高级的设计。正在这时候，一个计算机方面的厉害角色，出现在我的身边。
这个人叫Erik Winfree，是个德国裔的犹太人，只比我大两岁。他在计算机方面不是普通的高强，真称得上是圣手级。Erik的父亲Art Winfree是有名的教授，得过McArthur (Genius) Award，在美国那个叫天才奖。Erik也替Mathematica的创办人，也是加州理工前校友，另一个天才Steve Wolfram做过程序及研究。这种背景，计算机与逻辑的功力真是无庸置疑。Erik在拿到博士学位后，立刻被加州理工聘为教授，这是极少极少有的事。有其父必有其子，他后来也拿了一个McArthur (Genius) Award。
Erik和我常常就这个模型讨论，也在计算机方面给我的指导。Henry和Sela也很够意思，每有新资料就喂给我的模型。Sela和我也经常就这个模型进行讨论。讨论到一定程度是，就报告给Henry看还有没有要改进的地方。他们本来只要解释他们自己的数据，结果看哪个模型越来越厉害，连他们还没测量到数据也可以预测，就变本加厉把别的实验室量到，有关这种新潮蛋白质的资料也拿来看我们的模型是否能解释。给他们这样一搞，这个模型把那时所有的数据都不但解释，而且预测到了。
我所做出的这模型，不但可以解释Henry和Sela他们发现的现象，还可预测一些别的新的实验现象，这些预测到的现象，后来在其它的实验室如UCLA的名实验室中被发现，因此我做的模型在生物学界相当轰动，Henry和Sela到那一阵到什么地方都讲这模型。
Henry和Sela这两个老犹对我完成的工作满意极了，他们在我毕业后为我写求职推荐信时，把我写得非常完美。Henry和Sela是很典型的犹太人(Henry的儿子取名叫Ben，可想而知)我为此不但对他俩，也爱屋及乌，对所有的犹太人充满预先的敬意。
1995年，我从加州理工发表的第一篇科学论文，就是说明这个模型所统合的各种现象。
